中央空调停运后，冷却水系统和冷冻水系统的清洗可用采取单台设备清洗方式或全系统清洗方式。但无论是单台设备清洗还是全系统清洗，一般都使用清洗槽和清洗泵将单台设务或原系统(可使用原系统的水泵)构成一个闭合回路进行循环清洗。
清洗一般按下列程序进行。灭藻清洗、碱洗、封存、(中)钝化、碱洗后水冲洗、运行、(中和)预膜、酸洗、漂洗、酸洗后水冲洗、水冲洗(检漏)
发现情况及时修理：
中央空调是一个系统，在使用过程中如果出现不正常情况，应立即停机。应定期检查各部件，一旦发现小故障要及时处理，长时间故障运行会给中央空调带来更大的损坏，使用效果和寿命都会受到影响。
常见的冷水机组故障：
1.冷水机故障：逆相报警
2.压缩机电机线圈保护开关动作
3.容调动作不正确
4.电机无法启动或
5.电机无法启动或
6.排气温度高
7.液体管道过热
8.冷凝压力过高或过低
9.蒸发压力过高或过低
10.开机时，热力膨胀阀打不开
11.膨胀阀进口管结霜
12.膨胀阀发出“咝咝”响声
13.膨胀阀供液时多时少
14.开机后，阀很快堵塞
15.膨胀阀关不小
16.制冷剂不足
环境温度过高：压缩机应用相关手册中给出的要求是环境温度不超过40℃，因此在予以应用的时候就需要首先确认环境温度是否符合这样一个要求。一旦环境温度过高，就立即停机，以此来避免更大的损失发生；除此之外，还需要检查工作环境的通风状况以及冷却状况是否良好。通过这样一系列的检查、处理和保障，基本上就能够保障压缩机工作环境的温度符合要求。
轴承的损坏：如果振动感应器所感应到的振动是发生在轴承的附近，则可能的原因就是供油不足或者是存在着杂质，这样一些情况都有可能导致轴承磨损和振动的发生，这样一种情况发生以后就需要尽快的更换轴承。